Vad är helgenomsekvensering (WGS)?

Traditionella mikrobiologiska metoder har begränsningar när det gäller att identifiera källor och smittvägar för kontaminering, vilket gör det svårt för producenter att vidta riktade korrigerande åtgärder. 
Helgenomsekvensering ger unik inblick i Listeria‑bakteriens genetiska sammansättning. Metoden är avgörande för att påvisa genetiskt släktskap, egenskaper och samband mellan Listeria-fynd från olika provtagningsplatser. Med hjälp av denna teknik kan producenter övervaka produktionsmiljön och spåra korskontaminering av Listeria från råvaror, genom produktionsprocessen och hela vägen till färdig produkt. 

Vid varje Listeria-fynd kan producenter nu få svar på viktiga frågor såsom: 

• Kan samtliga Listeria-fynd i produktionsanläggningen spåras till samma källa?
• Finns Listeria redan i mina råvaror?
• Är återkommande fynd vid samma provtagningspunkt kopplade till samma Listeria-stam – en så kallad resident stam?
• Är den identifierade stammen kopplad till ett pågående utbrott?
• Har Listeria-stammen utvecklat resistens mot rengörings- och desinfektionskemikalier?
• Är stammen särskilt väl anpassad för att etablera sig i min produktionsmiljö, eller är den patogen?