Next-generation sequencing
Next-generation sequencing (NGS) er en avansert teknologi som gjør det mulig å bestemme rekkefølgen av basene i DNA. Teknologien har åpnet for nye muligheter innen genetiske analyser og gir detaljert informasjon om mikroorganismers arvestoff.
Økt kunnskap om hvilke mikroorganismer som finnes i produkter og produksjonsmiljøer, og hvordan de er genetisk beslektet, kan bidra til mer målrettede strategier for å forebygge og håndtere mikrobiologiske utfordringer.
Oppgradert bakterieidentifisering med NGS-PCR
Eurofins har oppgradert referansedatabasen som benyttes ved bakterieidentifisering med NGS-PCR. Databasen omfatter nå mer enn 16 000 bakteriearter og gir økt presisjon ved identifisering av bakterier på både slekts- og artsnivå.
Metoden analyserer hele den ribosomale regionen og gir bedre muligheter til å skille mellom nært beslektede bakteriearter enn tradisjonell 16S-sekvensering og MALDI-TOF. Referansedatabasen er grundig kvalitetssikret og vedlikeholdes i tråd med kravene i ISO 25184:2026.
Hva kan NGS-PCR benyttes til?
Den oppgraderte teknologien gir flere muligheter for bakterieidentifisering:
- Direkte analyse av næringsmiddelprøver: Identifisering av bakterier uten forutgående oppdyrking
- Analyse av bakterieflora på agarplater: Identifisering av bakteriekolonier på samme agarplate i én analyse
- Artsbestemmelse av enkeltkolonier: Presis identifisering av isolerte bakteriekolonier
Bedre grunnlag for mikrobiologiske undersøkelser
Den oppgraderte referansedatabasen gir bredere artsdekning og bedre muligheter for å identifisere nært beslektede bakterier.
For næringsmiddelindustrien, betyr dette mer detaljert informasjon om bakteriefloraen i produkter og prøver, som kan være nyttig ved kvalitetskontroll, undersøkelser av mikrobiologiske avvik og kartlegging av uønskede mikroorganismer.
Flere arter. Høyere presisjon. Bedre innsikt.