ddPCRについて詳しく知りたい方へ

ddPCRの原理、特長、FAQ、報告例、費用の考え方については「デジタルPCR(ddPCR)」をご覧ください。

 

 

サービスの特長

  • 0.005-0.1%のレアミューテーションの検出が可能です（BRAF V600Eの検出では0.001%オーダー）
  • 2チャネル（FAM、HEXまたはVIC）で構成されており、同一反応内で野生型と変異型の割合の算出が可能です

 

 

このようなお客様にお勧めします

  • リキッドバイオプシー研究を実施したい
  • 低頻度変異を高感度に検出したい
  • ゲノム編集の導入効率を評価したい

 

 

サービス基本仕様

1. DNA抽出
2. 品質評価
3. デジタルPCR
4. 変異型遺伝子検出/変異比率算出

※FFPEサンプルの場合、HE標本作製の病理医評価に基づく腫瘍領域のマクロダイセクションも実施できます

＊条件検討からの実施でカスタムのプライマー・プローブも使用可能です

 

 

解析フロー

こちらから、BIO RAD Laboratories, Inc.で合成・検証したプライマー・プローブのカタログをご確認いただけます。
** 市販DNA・合成遺伝子等を使用し数 wellでの検出確認、またはいくつかの濃度条件（7点前後）を振った検出限界の確認を行います。
*** 温度条件を8点設定し至適条件の検討を行います。
**** 濃度条件を数点（7点前後）振り、検出限界の検討を行います。 → 上記のアッセイワーク確認または至適条件検討後に実測検体の測定を行います。

 

 

受け入れサンプル

  • 全血（EDTA採血管など）
  • 血清、血漿
  • 組織、細胞
  • FFPEブロック
  • 未染スライド
  • DNA

    ※ その他サンプル性状の場合はお問い合わせください
    ※ サンプル準備～ご発送手順ページもご覧ください

 

 

報告書内容見本

2Dプロット図例
変異型と野生型のシグナルを2次元プロット上で可視化し、各ドロップレットの状態をご確認いただけます。

DNA変異解析 2Dプロット例

 

 

基本納品物

  • 試験報告書
  • 解析データ

 

 

納期

  • プライマー・プローブ調達：4～6週間程度
  • 条件検討：20営業日～
  • ddPCR解析：15営業日～

 

 

関連サービス

 

 

申込書/注意事項のダウンロード

申込書等ダウンロードサービスページをご利用ください。

 

 

ご注文について

ご注文方法は、事前に試験仕様等のお打ち合せをさせていただいたうえで、ご案内させていただきます。まずはお気軽にお問い合わせください。

 

変異解析のお見積りでは、以下の情報をご共有いただけるとスムーズです。 （未定の項目があっても構いません）

＜ご提供いただきたい情報＞

  • ご希望のサービス名(例：ddPCR 変異解析)
  • 生物種
  • サンプル性状（全血、血清、血漿、FFPEブロック、未染スライド、DNAなど）
  • サンプル数
  • ターゲット遺伝子名、変異領域
  • 解析区分：変異型遺伝子検出 / 変異比率算出
    ※FFPE由来または受け入れサンプル外のサンプルの場合は合わせてお問い合わせください。

 

 

お問い合わせ