Informations au niveau de l’espèce sur la microbiologie des sols, des substrats et de l’eau

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Des sols et substrats sains constituent la base de systèmes de culture résilients. Le profilage du microbiome utilise le séquençage de nouvelle génération (NGS) pour révéler la communauté microbienne complète dans le sol, le substrat et l’eau de serre, jusqu’au niveau de l’espèce.

Qu’est-ce que le séquençage du microbiome ?

Le séquençage du microbiome analyse l’ADN des champignons et des bactéries dans le sol, le substrat et l’eau de serre à l’aide de la technologie NGS. Il fournit une vue d’ensemble complète du microbiome au niveau des espèces, incluant à la fois les micro-organismes bénéfiques et les agents pathogènes.

Comment fonctionne le séquençage de nouvelle génération ?

Le séquençage de nouvelle génération (NGS) identifie les micro-organismes sur la base de leur ADN. Cela permet de distinguer entre elles des espèces appartenant au même groupe microbien.

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Quel est le lien avec Soil Life Monitor et DNA Multiscan ?

Soil Life Monitor

L’analyse Soil Life Monitor met en évidence les groupes fonctionnels de micro-organismes. Différents groupes, tels que les champignons et les bactéries, présentent des profils caractéristiques. Soil Life Monitor ne distingue pas les espèces individuelles.

DNA Multiscan

DNA Multiscan détecte des espèces pathogènes prédéfinies dans le sol, le substrat et l’eau.

NGS Microbiome Profiling

NGS analyse l’ADN de tous les micro-organismes présents dans un échantillon. Cela permet une distinction détaillée au sein des familles microbiennes et fournit une image complète du microbiome.

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Quand devez-vous utiliser le séquençage du microbiome ?

Le profilage du microbiome est utile lorsque :

  • Une analyse au niveau de l’espèce est nécessaire
  • Vous souhaitez distinguer les organismes bénéfiques des agents pathogènes
  • Des informations détaillées sur le microbiome du sol, du substrat ou de l’eau de serre sont nécessaires
  • Vous souhaitez comprendre les différences au sein d’un même groupe fonctionnel

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Que mesure le séquençage du microbiome ?

Le séquançage du microbiome identifie, quantifie et visualise les champignons et les bactéries au niveau de l’espèce. Il fournit un aperçu de la composition et de l’équilibre microbiens dans le sol, le substrat et l’eau de serre.

Voir notre vidéo sur le séquençage de nouvelle génération

Séquençage de nouvelle génération

Utiliser l’ADN pour déterminer le microbiome

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