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La biomasa microbiana es el número total de microorganismos (suma del número de bacterias, hongos y protozoos). Esta suma de todos los PLFAs es una indicación de la cantidad de microbios. Dado que los PLFAs se degradan rápidamente tras la muerte de un organismo, representa principalmente la biomasa microbiana viva.
La biomasa microbiana es también un indicador de la supresión general de enfermedades. Cuantos más microorganismos haya, mayor será la competencia con los patógenos por el espacio y el alimento.
La biomasa microbiana puede aumentarse añadiendo materia orgánica efectiva como compost, estiércol sólido, abonos verdes o cultivando cereales (incl. paja). Otros ejemplos de medidas son la reducción del laboreo del suelo, la cobertura permanente del suelo, los pastizales temporales o una menor roturación de los pastizales permanentes.
La biomasa microbiana es un indicador importante de la salud del suelo. El carbono en la biomasa microbiana (mg C kg -1) se calcula a partir de la biomasa microbiana total (mg PLFA por kg).
El carbono en la biomasa microbiana es una medida que se utiliza a menudo en otras mediciones y estudios. El carbono en la biomasa microbiana, bacteriana y fúngica se muestra en el informe para poder comparar este parámetro con otros estudios.